TYPE-MOON

O cenário de Fate/Apocrypha se passa em um mundo paralelo ao de Fate/stay night, onde o Grande Cálice foi removido de Fuyuki após a Terceira Guerra do Santo Graal e desapareceu por muitos anos.
Por volta dos anos 2000, época em que deveria ocorrer a Quinta Guerra do Santo Graal, o grupo que roubou o Cálice, Yggdmillennia, declara abertamente sua secessão da Associação dos Magos e revela que está em posse do Santo Graal.
A Associação envia cinquenta magos para recuperá-lo, mas quase todos são massacrados instantaneamente por Lancer of Black. Apenas um sobrevive e consegue ativar o sistema de reserva do Grande Cálice, permitindo a invocação de catorze Servos no total.
Isso marca o início da Grande Guerra do Santo Graal em Trifas, onde duas facções entram em conflito:
Facção Negra (Black Faction) — composta pelos membros da Yggdmillennia.
Facção Vermelha (Red Faction) — formada pelos magos enviados pela Associação dos Magos, com exceção de um representante da Igreja.
O próprio Cálice também convoca Ruler, que assume o papel de mediador da guerra.

Lutando para entender sua memória fragmentada, o estudante do ensino médio Hakuno Kishinami chega à escola com uma forte dor de cabeça.
Olhando pela janela da sala de aula, ele vê duas garotas lutando no pátio. O impacto do combate faz as janelas se estilhaçarem, mas, para sua surpresa, os outros alunos não reagem. De repente, um homem de armadura entra na sala e começa a massacrar os estudantes com sua lança, forçando Hakuno a correr para salvar sua vida.
Depois de escapar do frenesi do cavaleiro, Hakuno percebe que está completamente amnésico, lembrando apenas das palavras “Guerra do Santo Graal”. Vagando pela escola deserta, ele percorre o prédio até ser atacado por dois desconhecidos. Sangrando e cercado por corpos, ele se agarra à vida sem ter nenhuma lembrança de quem realmente é.
Quando os agressores se preparam para acabar com Hakuno, uma voz misteriosa o chama de volta à realidade. Uma mulher de vestido vermelho vibrante aparece diante dele, dizendo que seu fim ainda não chegou. Identificando-o como seu Mestre, ela empunha sua lâmina contra os inimigos, selando um contrato que guiará Hakuno através das provações e tribulações que estão por vir.