“De um planeta moribundo virão os filhos da luz…”
Durante as férias em uma pequena ilha, a jovem Shiina Tamai mergulha próximo a um antigo santuário e descobre uma criatura extraterrestre em forma de estrela-do-mar. Ela quase se afoga, mas é salva pelo estranho e silencioso ser de olhos arregalados, a quem ela dá o nome de Hoshimaru.
Para sua surpresa e alegria, a criatura pode mudar de forma, permitindo que Shiina suba nele e os dois voem pelas nuvens. O que parece um sonho infantil logo se transforma em algo muito mais sombrio, à medida que Shiina e Hoshimaru se veem envolvidos em um conflito entre facções extraterrestres rivais.
Nessa guerra travada nos céus, sobre gigantescas criaturas alienígenas chamadas Dragões das Sombras, o destino da Terra está em jogo.